经高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）奖励委员会评审，教育部发布“2014年度高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）奖励的决定”，复旦大学作为第一完成单位分别获得自然科学一等奖5项、自然科学二等奖7项、科技进步一等奖1项、科技进步二等奖5项。其中，医口基础医学院袁正宏教授领衔的项目“乙型肝炎病毒与I型干扰素系统相互作用的新机制”获自然科学一等奖，基础医学院雷群英教授领衔的项目“乙酰化调控肿瘤代谢”、生物医学研究院杨芃原教授领衔的项目“蛋白质组高效富集、酶解和质谱分析新技术和新方法”获自然科学二等奖。华山医院冯晓源教授领衔的“影像学对脑胶质瘤诊断和治疗的指导与创新应用”获科学技术进步奖一等奖，华山医院董强教授领衔的“脑出血后继发性脑损伤新机制与微创治疗新策略的转化医学研究”、肿瘤医院李进教授领衔的“胃癌发生发展的分子机制研究与临床治疗新策略的建立和应用”、眼耳鼻喉科医院徐建江教授领衔的“角膜病关键诊疗技术的临床研究”、中山医院符伟国教授领衔的“主动脉夹层腔内治疗的拓展与优化”、儿科医院桂永浩教授领衔的“先天性心脏病产前诊断及早期干预策略的建立和推广”获科学技术进步奖二等奖。
高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）主要授予在科学发现、技术发明、促进科学技术进步和专利技术实施等方面做出突出贡献的个人和单位。2014年度高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）推荐工作分为自然科学奖、技术发明奖、技术进步奖（包括推广类）和专利奖四个奖种。其中，推荐自然科学奖要求主要论著必须是2013年10月31日以前在国内外公开发行的学术期刊上发表的论文或出版的专著，并得到了同行学者的相应评价。
2014年度高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）获奖项目共294项，一等奖101项，二等奖193项。其中，自然科学奖获奖项目共129项，一等奖42项，二等奖87项，技术发明奖获奖项目共43项，一等奖20项，二等奖23项。
