复旦大学上海医学院（简称“复旦上医”）地处上海市徐汇区，创建于1927年，创立时名为国立第四中山大学医学院，是中国人创办的第一所国立大学医学院，颜福庆出任首任院长。1932年，独立为国立上海医学院。院训是“正谊明道”，出自《汉书·董仲舒传》：“正其谊不谋其利，明其道不计其功。”1939年，因抗战爆发内迁至云南昆明。1940年，辗转迁至四川重庆。1946年，抗战胜利，迁回上海。1952年，更名为上海第一医学院。1959年，被定为全国16所重点高等学府之一。1985年，更名为上海医科大学。2000年，上海医科大学和复旦大学合并办学，组建成为新的复旦大学。2012年，新的上海医学院成立，作为复旦大学党政的派出机构，根据学校的授权，在大医口的人才培养、科学研究、学科建设、发展规划、资源配置、对外交流等方面，行使相对独立的管理权限。2017年，中共复旦大学上海医学院工作委员会成立，是学校党委的派出机构。2018年12月21日，教育部、国家卫生健康委员会、上海市人民政府签署共建托管复旦大学上海医学院及其直属附属医院的协议。2019年6月14日，复旦大学上海医学院领导班子宣布会议举行。上海市委决定，建立中共复旦大学上海医学院委员会和中共复旦大学上海医学院纪律检查委员会。同日，复旦大学上海医学院高水平地方高校试点建设正式启动。
复旦大学上海医学院设有本科专业8个：临床医学（含八年制、五年制、六年制）、口腔医学、基础医学、法医学、预防医学、公共事业管理、药学、护理学。现有博士学位授予权的一级学科9个（医学门类6个，非医学门类3个），专业学位博士授权点4个，专业学位硕士授权点7个。设有博士后科研流动站8个：生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、公共管理（医）、护理学。
复旦大学上海医学院拥有专任教师782人、专职科研人员219人，其中高级职称639人。有中国科学院院士10人，中国工程院院士4人。全院在校生12803人（含留学生263人），其中博士研究生4650人，硕士研究生3803人，普通本科生4350人。
复旦大学上海医学院设有直属院所平台12个：基础医学院、中山临床医学院、华山临床医学院、公共卫生学院、药学院、护理学院、口腔医学院、法医学与法庭科学学院、生物医学研究院、脑科学研究院、放射医学研究所、唐仲英健康治理高等研究院；实体运行科研机构10个：脑科学转化研究院、上海市重大传染病和生物安全研究院、生殖与发育研究院、智能医学研究院（筹）、营养研究院（筹）、感染与健康研究院（筹）、医学遗传研究院（筹）、法庭科学研究院（筹）、临床科学研究院（筹）、化学生物医院研究院（筹）。拥有复旦大学附属中山医院、复旦大学附属华山医院、复旦大学附属肿瘤医院、复旦大学附属妇产科医院、复旦大学附属儿科医院、复旦大学附属眼耳鼻喉科医院、复旦大学附属华东医院、上海市公共卫生临床中心、上海市质子重离子医院、上海市口腔医院、复旦大学附属金山医院、上海市第五人民医院、上海市浦东医院、上海市静安区中心医院、上海市闵行区中心医院、上海市青浦区中心医院、上海市徐汇区中心医院等十余家附属医院，以及34家复旦大学上海医学院共建社区卫生服务中心（含筹）。
复旦大学上海医学院现有基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、护理学等6个一级学科，口腔医学、法医学一级学科正在布局建设中。其中基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、中西医结合等5个学科为国家“双一流”建设学科，基础医学、公共卫生与预防医学、中西医结合等3个学科为上海市高峰学科。有国家临床医学研究中心2个：国家老年疾病临床医学研究中心、国家放射与治疗临床医学研究中心；国家医学中心4个：综合类国家医学中心（中山医院）、国家儿童医学中心（儿科医院）、国家神经疾病医学中心（华山医院）、国家传染病医学中心（华山医院）；有全国重点实验室3个：脑功能与脑疾病全国重点实验室、克服递药屏障高端制剂全国重点实验室、心脏病全国重点实验室；国家工程实验室1个：治疗性疫苗国家工程实验室；国家产教融合创新平台1个：医学攻关（疫苗）国家产教融合创新平台；国家临床医学研究中心2个：放射与治疗国家临床医学研究中心、老年疾病国家临床医学研究中心；教育部前沿科学中心1个：脑科学；教育部重点实验室5个：医学分子病毒学、代谢分子医学、智能化递药、公共卫生安全、癌变与侵袭原理；国家卫生健康委重点实验室9个：糖复合物、抗生素临床药理、肢体功能重建、卫生技术评估、医学分子病毒学、听觉医学、近视眼及相关眼病、缺血性心脏病、新生儿疾病；上海市重点实验室20个：周围神经显微外科、医学图像处理与计算机辅助技术、器官移植、女性生殖内分泌相关疾病、肾脏疾病与血液净化、视觉损害与重建、乳腺肿瘤、出生缺陷防治、老年医学临床、医学表观遗传学、肺部炎症与损伤、脑功能重塑及神经再生、传染病与生物安全应急响应、放射肿瘤学、围手术期应激与保护、胰腺肿瘤精准诊疗（筹）、生殖与发育（筹）、肿瘤治疗新靶点发现与抗体药物（筹）、脑机接口临床试验与转化（筹）、罕见病基因编辑与细胞治疗（筹）。（2025年6月更新）
